Elle comprend 3 membres nommés par chaque collège et validés par le conseil d'Administration de l'ISQ. Ces membres sont choisis en dehors de ceux des commissions d'instructions et des représentants de l'intérêt général.
L'instance d'appel est l'instance collégiale compétente pour le traitement :
L'instance d'appel peut décider d'une nouvelle instruction de dossier, maintenir une qualification ou l’annuler.